Kostel Všech svatých s kostnicí byl postaven v 1. polovině 14. století na území zaniklého cisterciáckého kláštera Sedlec v Kutné Hoře. Sedlecká kostnice je pietní prostor posledního odpočinku tisíců lidí a zároveň funkční sakrální prostor, kde se konají mše.
Gotický dvoupodlažní kostel vznikl na místě bývalého kláštera a hřbitova. Dolní kaple sloužila k pietnímu ukládání kostí, horní kaple byla naopak místem modliteb a setkávání s Bohem; ve stejné době byla původní skleněná okna horní kaple zazděna a vnitřní prostor byl postupně upravován. Horní kaple je světlem prosvětlená, zatímco dolní kaple zůstává tmavá a ponurá - obě části spolu tvoří unikátní dvoupodlažní dispozici.
Historie Sedlecka je poznamenána morovými a válečnými ranami: po morové ráně roku 1318 bylo zde pohřbeno až 30 tisíc lidí a během husitských válek dalších 10 tisíc. Exhumované kosti byly uloženy podzemně i nadzemně v kostnici a vznikaly pyramidy a další netradiční dekorace z lidských kosterních ostatků. V 18. století, v době barokizace, byla hlavní výzdoba doplněna Santiniho dílem - architekt Jan Blažej Santini-Aichel zavedl do interiéru barokní prvky a předsíňovou vestavbu pro statickou stabilitu stavby.
Unikátní výzdoba kostnice je dílem Františka RinTRA z České Skalice, který v roce 1870 doplnil kosterní výzdobu o erb Schwarzenbergů a své jméno. Kosti byly dezinfikovány a vyběleny chlorovým vápnem; lustr tvořený velkými kostmi a další makabrózní dekorace symbolizují memento mori - pamatuj na smrt. Naděje na vzkříšení a Boží soud jsou centrálními tématy výzdoby dolní kaple, doprovájené anděly a lebkami.
V 19. století došlo k dalším úpravám a dolní kaple se stala součástí rekonstrukce kláštera. Po zániku kláštera v roce 1784 přešel Sedlec do držení rodu Schwarzenberků z Orlíka; jejich mistr František Rint z České Skalice zhotovil v roce 1870 výraznou výzdobu z kostí a lebek, která byla doplněna erbem Schwarzenbergů a podpisem autora. V současnosti je kostnice součástí Sedleckého hřbitovního kostela a jeho areálu s klášterem, v němž návštěvníci mohou obdivovat i blízkou UNESCO katedrálu Nanebevzetí Panny Marie a sv. Barbory.
Kostnice je nejen turistickou památkou, ale i stále funkčním místem, kde se konají mše. Kapacita je omezená a vstupenky je nutné kupovat online s rezervací data a času, protože čas vstupu je pevně stanoven a po samotném vstupu nelze změnit. Maximální doba návštěvy dolní kaple je 30 minut, zatímco horní kaple umožňuje delší pobyt. Návštěvníkům jsou k dispozici letáčky a možnost komentované prohlídky pro skupiny za příplatek.
Podzemní kaple Sedlecké kostnice jsou vyhledávaným místem i pro svou souvislost s místní historií a náboženskou symbolikou. Hřbitov Sedlec zahrnuje období 13.-16. století a výzkumy odhalily třicet desítek hromadných hrobů s ostatky tisíců obětí epidemí a hladomoru, různé doby pochování a rozvrhnutí hřbitova. Nejstarší hroby bývají datovány do doby hladomoru v roce 1318, mladší do morové epidemie 1348-1350, přičemž některé hroby jsou ještě mladší. Archeologické nálezy představují největší soubor z vrcholného středověku v Čechách a hromadné hroby jsou unikátní i v evropském kontextu.
V současnosti probíhá rekonstrukce památky zahájena v roce 2014; práce mají být dokončeny kolem roku 2030. Hlavním důvodem rekonstrukce je statická porucha způsobující naklonění objektu; maximum odchylky stěny věže od svislice činí 460 mm a je způsobena nedostatečnou únosností zeminy. Z tohoto důvodu bylo nutné zajistit základové konstrukce a vyřešit naklánění. V rámci restaurátorských zásahů byl Santini spolu s přístavbou západní předsíně původně řešením, avšak postupné rekonstrukce dále řešily problematiku vnitřní výzdoby a statiky.
V budoucnu má být otevřena nová expozice Memento Mori, která vzniká v podzemí pod dolní kaplí a bude zahrnovat audiozamyšlení návštěvníků a kurátorsky řízené umělecké instalace s tématem konečnosti života a relativity času. Expozice má být doprovázena pravidelnými instalacemi a bude spolupracovat s historikem umění Ottou M. a kurátory filmařů Viktora Portela a Dominika Dolejší. Nová expozice má otevřít 1. dubna 2027.
